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肠道菌群研究再突破!顶刊Science:北大“大牛”教授团队提出“肠道菌源宿主同工酶”新概念,揭示降糖的潜在靶点
肠道菌群在人体代谢性疾病中扮演着重要角色,甚至被称为“人类的第二大脑”。近年来,越来越多的肠道菌群相关项目得到了国家自然基金资助,同时也涌现了许多探究肠道菌群深层机制的高分优秀文章。
但由于肠道菌群的成非常复杂,因此一直缺乏对功能性分子或小分子代谢物的相关研究。那么,该从哪方面切入去开展研究,才能兼备创新性和实用性呢?和小编一起来看看这篇文章吧!

近日,北京大学医学部姜长涛教授联合北京大学第三医院乔杰院士、化学学院雷晓光教授等多研究团队在Science杂志发表了研究成果[1]首次提出了肠道菌源宿主同工酶新概念,发现:菌源宿主同工酶在肠道中广泛存在,能够模拟宿主酶的功能,参与疾病的发生发展;此外,还发现了首个对菌源DPP4具有高活性和强选择性的小分子抑制剂Dau-d4,可通过特异性抑制菌源DPP4,改善糖耐量异常,为靶向肠道菌群的代谢性疾病的精准化治疗带来新突破


一、研究内容与思路
1、微生物-宿主同工酶的功能筛选
研究者建立了一个筛选平台来鉴定可能影响宿主功能的微生物-宿主同工酶,收集了3名健康志愿者的新鲜粪便样本以及小鼠的新鲜粪便样本,对110种在各种人类疾病中起作用的酶进行了筛选。利用该系统,研究者发现71种酶在肠道菌群中存在同工酶,而这些酶种类多样、功能全面,提示菌源宿主同工酶在肠道中广泛存在,可能有效模拟宿主酶的功能。
在所有的人类样本中菌源宿主同工酶活性最高的是DPP4。此外,饲养在普通环境的小鼠粪便中,DPP4活性显著高于无菌小鼠。DPP4是一个常用的2型糖尿病治疗靶点,肠道DPP4是降解GLP-1调节葡萄糖耐量所必需的。
基于上述理论基础,研究者给予无菌小鼠广谱抗生素灌胃处理。结果发现,小鼠肠外组织和血浆的GLP-1活性和总水平却没有变化。但当给小鼠喂食HFD且增加了肠道屏障通透性或给予低浓度葡聚糖硫酸钠(DSS)或吲哚美辛增加肠通透性后,发现可见DPP4活性增加和GLP-1活性降低,糖耐量异常。

研究思路:研究者构建了一个新的筛选平台,在人类以及小鼠新鲜粪便样本发现了菌源宿主同工酶的存在,并以最活跃的DPP4为研究对象开展后续研究。首先,研究者探索了“在什么情况下会影响肠道DPP4以及GLP-1”,以便开展后续实验。


2、产生DPP4的细菌的鉴定
进一步,研究者鉴定了DPP4的微生物生产者。通过肠道共生菌株的分离培养、DPP4活性检测,发现了多形拟杆菌、普通拟杆菌等多种拟杆菌属细菌均具有菌源DPP4活性。同时,研究者还发现菌源DPP4(btDPP4)对GLP-1活性最强,甚至高于人类DPP4(hDPP4)

研究思路:明确了“在肠道屏障受损时DPP4会发生变化”后,研究者进一步定位了分泌DPP4影响肠道的具体菌群,为后续构建动物模型作铺垫。


3、微生物DPP4破坏宿主葡萄糖稳态
研究者探究了DPP4在宿主葡萄糖代谢中的作用,采用CRISPR-Cas4系统并构建多种小鼠模型来过表达或沉默DPP4进行研究,给予HFD破坏了肠道屏障,最终发现:多形拟杆菌可以以btDPP4依赖的方式降低宿主活性GLP-1水平,诱导糖耐量异常。

研究思路:第二步研究发现多形拟杆菌会分泌DPP4,加上已有相关研究表明“DPP4是2型糖尿病的疾病治疗靶点之一”,基于此,研究者验证了在小鼠模型中,DPP4在葡萄糖代谢中发挥的作用,与第一步研究相呼应,同时点明了btDPP4的重要作用。


4、临床DPP4抑制剂不抑制微生物DPP4
研究者研究了DPP4抑制剂西格列汀是否可以抑制微生物DPP4,结果发现,西格列汀对btDPP4的抑制作用较弱。进一步分析发现,可能原因是btDPP4-西格列汀复合物结构存在弱TMTP接触导致的,可变V/VI接头基序可能是西格列汀对不同DPP4抑制效果不同的结构基础。
研究者进一步开展了西格列汀临床试验和动物研究,采用多组学关联分析、菌群移植、噬菌体靶向干预等多项实验,发现多形拟杆菌产生的btDPP4影响了西格列汀的治疗效果,解释了为什么西格列汀抑制效果因人而异。此外,还表明,后续需要抑制hDPP4和btDPP4,以更有效地改善葡萄糖稳态。

研究思路:西格列汀是临床常用DPP4抑制剂,但疗效因人而异,原因一直有待发掘。研究者探究了西格列汀是否能影响btDPP4,结果显示影响较小,可能原因是:西格列汀只影响了hDPP4而弱作用btDPP4,导致治疗效果较差。这一步将科研与临床实际相结合,提出了适合的临床治疗改进方案。


5、Dau-d4是一种特异性btDPP4抑制剂
研究者建立了一种使用btDPP4蛋白的高通量药物筛选系统,通过对约107,000个小分子化合物的高通量筛选,发现了蝙蝠葛苏林碱(Dau)具有最强的btDPP4抑制活性,但对hDPP4没有抑制作用。

进一步的结构改造与活性评价显示,Dau的衍生物Dau-d4对菌群DPP4有着很强的抑制作用,还对hDPP4存在一定抑制作用,从而在不影响肠道共生菌的生长与组成的情况下改善了糖代谢紊乱。


研究思路:既然提出了疑问,那就需要寻找适合的解决方法——研究者采用高通量药物筛选系统发现了Dau,通过验证其功能后发现存在一定的缺陷,因此后续在此基础上不断地挖掘,最终发现了衍生物Dau-d4。


6、Dau-d4改善葡萄糖稳态
接下来,研究者探究了Dau-d4在小鼠中的具体治疗效果,针对Dpp4-/-小鼠、ob/ob小鼠等多种动物模型给予HFD、DSS饮水等条件以及Dau-d4治疗,发现Dau-d4均可以通过抑制btDPP4,增加活性GLP-1,改善糖耐量异常,且不会对肠道菌群生长产生抑制,也不存在肝肾毒性。除此之外,Dau-d4与西格列汀联合治疗还可以改善西格列汀单独治疗带来的副作用。


研究思路:发现了抑制药物之后,接下来便是验证药物的疗效、安全性以及与当前临床治疗药物西格列汀的比较或联合治疗效果。


二、小结
菌源DPP4可能是2型糖尿病的治疗靶点,而DPP4抑制剂Dau-d4可以在不干扰菌群整体功能的条件下,特异性靶向菌源DPP4,同时对人DPP4存在一定抑制作用,有效改善代谢紊乱,是潜在的治疗2型糖尿病的新型药物。
该研究开发了一种鉴定未表征的肠道微生物-宿主同工酶的新策略,筛选出活性最高的主角DPP4,之后开展了一段“发现靶点--机制验证--药物筛选和疗效验证的全链条研究体系,为开发新治疗方法提供了可能。


2023-9-5
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